Näidendi sündmused toimusid Egiptuses, Alexandria linnas, XIII dünastia valitsemisaja lõpus, aastal 48 eKr. Caesari leegionid sisenevad Egiptusesse. Linn on paanikas. Kuueteistaastane tüdruk kuninganna Cleopatra kadus. Nad ei leia teda kuskilt.
Sel ajal möödub Julius Caesar üksi kõrbes Sfinksi väikesest eksemplarist ja näeb Kleopatrat magamas kivikuju rinnal. Ta ärkab, ütleb, et on Egiptuse kuninganna, ja kutsub Caesari, keda ta nimetab "vanameheks", tema sisse ronima ja ka roomlaste eest varjama. Cleopatra kardab neid hullupööra. Caesar tunnistab, et ta on roomlane, ja ütleb, et kui tüdruk teeb kõik, nagu ta ütleb, Caesar teda ei solva. Cleopatra lubab saada tema orjaks ja kuuletub talle kõiges. Siis teevad nad lõplikult läbi kõrbe paleesse.
Cleopatra on palees äärmiselt pelglik. Ta kardab orjale korraldusi anda, väriseb oma lapsehoidja Ftatatita ees. Caesar õpetab teda kuninglikult käituma, käskima ja sundima ennast alluma. Kleopatra saab maitset ja unistab juba sellest, kuidas ta orjad mürgiga “ära toidab” ja Niilusele viskab, et krokodillid tükkideks rebida. Caesar palub, et ta ei pääseks minema. Siiski kardab ta endiselt väga Caesari. Kui Rooma sõdurid sisenevad paleesse, tervitades tema kõrval asuvat inimest sõnadega: “Au keisrile!”, Saab Cleopatra äkki nende mõtte ja kergenduse saatel langeb ta käsi.
Tsaar Ptolemaios Dionysus (kümneaastane poiss, Kleopatra vend ja tema rivaal) ja tema eestkostja Potin sisenevad palee alumisse saali. Neid saadavad kuninga juhendaja Theodotus, tema sõjaväeline juht Achilleus ja kohusetäitjad. Ptolemaios üritab Potini õhutusel väljendada oma rahulolematust Caesari sissetungi ja Cleopatra käitumisega. Caesar siseneb ruumi, kaasas Rooma ohvitser Ruthius ja tema sekretär, rahvusest britt britt, kes on riietatud sinisesse värvi. Caesar ei kipu Egiptuses verd valama, kuid ta nõuab, et talle makstaks osa rahasummast, mille Egiptus peaks Roomale andma vastavalt Caesari ja endise Egiptuse kuninga vahel sõlmitud vanale kokkuleppele selle eest, et Caesar aitas kunagi trooni taastada. Cleopatra, kes otsustas käituda kuningannana, jookseb oma venna juurde, tõmbab ta troonilt maha ja istub ise tema asemele. Poisi kurbusest puudutatud Caesar rahustab teda õrnalt.
Egiptuse kohtunikud ja sõjaväe juhid nõuavad, et Caesar lahkuks nende maalt, kuid ta vastab, et teeb seda alles pärast seda, kui Cleopatra saab kuningannaks. Ta lubab kõigil egiptlastel pensionile jääda, oma kaaslaste suure nördimusega, ja hoiatab, et ta ei saa pikka aega Ruthi ja tema sõdureid vaos hoida ning neid, kes innukalt tahavad mõõka oma kestadest kinni tõmmata. Potin kahetseb kibestunult Rooma õiglust, roomlaste vähest tänulikkust. Caesar on kahjumis. Ta ei saa aru, mis on kaalul. Seejärel palub Potin lahkuda Lucius Septimiusel, kes ütleb, et ta tappis Caesari lüüa soovinud vabariiklase Pompey. Caesar on jahmunud, teda kohutab Lucius Septimiuse kuritegu.
Egiptlased lahkuvad. Caesar jääb Cleopatra juurde, kes teda liigse tundlikkusega noomib. Samuti räägib ta, kuidas tema isal õnnestus troon tagasi saada. Ja teda aitas ilus noormees, kes saabus Rooma koos paljude ratsanikega. Siis oli Cleopatra vaid kaksteist aastat vana, ta armus sellesse noormehesse. Ta on väga üllatunud, kui Caesar ütleb meile, et just tema saatis Mark Anthony oma isa aitama. Caesar lubab naisele, et kui ta seda soovib, saadab ta selle talle.
Caesar käsib Ruthiusel põletada mitu Rooma laeva, mis seisavad läänesadamas, ning võtta kõik idasadamas seisavad paadid ise kinni ja vallutada tuletorniga saar Faros. Potin tuleb Caesari juurde ja kavatseb talle egiptlaste nõudmisi avaldada. Seekord vangistab Caesar teda. Siis jookseb Theodotus kohale ja teatab ülipõnevalt, et Rooma laevadelt levinud tuli levis Aleksandria raamatukokku, Egiptuse tsivilisatsiooni pühade pühasse. Caesar soovitab tal kutsuda abi Achilleuse ja tema armee tulekahju kustutamiseks. (Nii kavatseb ta suunata Achilleuse tähelepanu roomlaste poolt Farose saare hõivamisele.) Caesar paneb oma raudrüü ja lahkub Farose vallutamisest. Cleopatra palub tal olla ettevaatlik.
Pärast Caesari lahkumist muldkehale, kus seisavad Rooma valvurid, ilmub Sitsiilia patritslane, kunstihuviline Apollodorus. Ta toob paleesse Pärsia vaibad, soovides, et Cleopatra valiks neist mõne. Kuninganna ise jookseb paleest välja. Ta soovib kohe paati pääseda ja Caesari poole purjetada. Kuid valvur ei luba tal seda teha. See on vastuolus Caesari korraldusega. Siis palub Cleopatra Apollodorult laevaga Caesarile tema kingitusena saata ilusa Pärsia vaiba ja saada temalt saarele purjetamiseks loa. Ta jookseb vaipa valima. Varsti toimetavad portmehed paleest kingituse, panevad selle paati ja Apollodorus seab kaldalt purjeka. Kui paat on juba valvurist kaugel, teatab Ftatitita sarkastiliselt, et ta jäi Cleopatrast mööda, kuna naine sattus siiski paati, olles mähitud vaibale.
Saare poole purjetab paat. Sel ajal viskab keegi raske koti vette, paadi nina puruneb ja see vajub ära. Vaevalt Apollodorus õnnestub vaip veest välja saada. Sel ajal, kui Caesar, britid ja Rufius vaimustunult Apollodorust ja tema koormat jälgisid, maandusid egiptlased kaldale. Roomlased ja Cleopatra saavad ainult ujuda. Caesar ujub, kandes Cleopatrat selga. Varsti läheneb neile paat ja nad liiguvad pardal.
Järgmised sündmused toimuvad märtsis 47, see tähendab kuus kuud pärast esialgseid sündmusi. Potin, keda Caesar endiselt vangistuses hoiab ja palees elab, otsib Cleopatraga publikut ja käitub selle ajal alama ja lugupidavalt, mõnikord üritab kuninganna Caesari vastu seada, kuid Cleopatra ajab ta minema. Ta läheb Caesari juurde ja soovib teda Cleopatra vastu innukalt taastada, kuid tal pole selleks aega, sest kuninganna ise siseneb sisse, minnes einestama koos Caesari, Apollodoruse ja Ruthiusega. Caesar palub Potinil öelda, mida ta öelda tahtis, või lahkuda, sest see annab talle vabaduse. Potin hakkab pärast mõningast segadust teda inspireerima, et Cleopatra soovib Egiptust üksinda valitseda ja ootab kogu südamest tema lahkumist. Cleopatra väidab nördinult, et see on vale. Caesar leiab, et isegi kui see nii oleks, oleks see üsna loomulik. Ta palub Potinil lahkuda ja kordab, et on vaba. Cleopatra keeb vihast ja käsib Ftatiteel vaikselt Potini tappa enne, kui ta paleest lahkub. Lõuna ajal kuulevad kõik järsku karjumist ja keha häält. Lucius Septimius siseneb ja teatab Caesarile, et Potin tapeti ja linn läks hulluks, kuna Potin oli linnaelanike lemmik. Cleopatra tunnistab, et ta käskis Potini tappa tema laimu eest. Rufius ja Apollodorus kiidavad tema teo heaks. Caesar aga ütleb, et nüüd ei suuda ta kuninganna elu vihaste egiptlaste eest kaitsta. Lucius Septimius rahustab teda. Ta teatas, et tugevused saabusid roomlastele - Pergamoni Mithridate armeele. Caesar läheb Mithridates kohtuma. Enne lahkumist torkab Ruthius vaikselt Ftatatitat nagu metsikut tiigrit, kes võib igal hetkel rünnata, nagu ta hiljem oma teo Caesarile selgitab. Ta kiidab ta heaks. Rooma väed purustavad egiptlased, kuningas Ptolemaios upub jõkke ja Cleopatrast saab suveräänne valitseja.
Caesar valmistub purjetama Rooma. Enne Egiptusest lahkumist jätab ta Rufiuse kuberneriks. Cleopatrasse kordab ta lubadust saata Mark Anthony.